რა განსხვავებაა 16s rRNA-სა და 18s RRNA-ს შორის?

2024 ავტორი: Miles Stephen | [email protected]. ბოლოს შეცვლილი: 2023-12-15 23:37

Მთავარი შორის განსხვავება ანალიზების ჩატარებასთან ერთად 18S rRNA გენის მონაცემების ნაცვლად 16S rRNA გენის მონაცემები (ან ITS მონაცემები) არის საცნობარო მონაცემთა ბაზა, რომელიც გამოიყენება OTU არჩევისთვის, ტაქსონომიური მინიჭებისთვის და შაბლონზე დაფუძნებული განლაგების აგებისთვის, რადგან ის უნდა შეიცავდეს ევკარიოტულ თანმიმდევრობებს.

ამის გათვალისწინებით, რატომ გამოიყენება 16s rRNA გენი იდენტიფიკაციისთვის?

The 16S რიბოსომური რნმ გენი კოდირებს ბაქტერიული რიბოსომის 30S ქვედანაყოფის რნმ-ის კომპონენტს. დნმ-დნმ-ის ჰიბრიდიზაციის სირთულის გამო, 16S rRNA გენი თანმიმდევრობა არის გამოყენებული როგორც ინსტრუმენტი იდენტიფიცირება ბაქტერიები სახეობის დონეზე და ხელს უწყობს მჭიდროდ დაკავშირებული ბაქტერიების სახეობების დიფერენცირებას [8].

გარდა ამისა, აქვთ თუ არა ევკარიოტებს 16s rRNA? The 16S rRNA გენი არის ყველა ბაქტერიაში და მსგავსი ფორმა გვხვდება ყველა უჯრედში, მათ შორის უჯრედებშიც ევკარიოტები.

ასევე კითხვაა, რა არის 18s და 28s rRNA?

The 28S / 18S რიბოსომური რნმ თანაფარდობა ხშირად გამოიყენება ნებისმიერი მოცემული ნიმუშიდან გაწმენდილი მთლიანი რნმ-ის ხარისხის შესაფასებლად. ადამიანებში, 28S rRNA აქვს ~ 5070 ნუკლეოტიდი და 18S აქვს 1869 ნუკლეოტიდი, რაც იძლევა ა 28S / 18S თანაფარდობა ~2.7. Მაღალი 28S / 18S თანაფარდობა მიუთითებს იმაზე, რომ გაწმენდილი რნმ ხელუხლებელია და არ დეგრადირებულია.

რა არის 16s rRNA თანმიმდევრობა?

16S rRNA გენი თანმიმდევრობა ანალიზი არის სტანდარტული მეთოდი ბაქტერიების ტაქსონომიაში და იდენტიფიკაციაში და ეფუძნება გამოვლენას თანმიმდევრობა განსხვავებები (პოლიმორფიზმი) ჰიპერცვლადი რეგიონებში 16S rRNA გენი, რომელიც არის ყველა ბაქტერიაში.