ვიდეო: როგორ გამოითვლება გასწორების ქულა?
2024 ავტორი: Miles Stephen | [email protected]. ბოლოს შეცვლილი: 2023-12-15 23:37
The ქულა of an გასწორება , ს, გათვლილი როგორც ჩანაცვლებისა და უფსკრულის ჯამი ქულები . Ცვლილება ქულები მოცემულია საძიებო ცხრილით (იხ. PAM, BLOSUM). უფსკრული ქულები არიან როგორც წესი გათვლილი როგორც G-ის ჯამი, ხარვეზის გახსნის ჯარიმა და L, უფსკრული გაფართოების ჯარიმა. n სიგრძის უფსკრულისთვის, უფსკრული ღირებულება იქნება G+Ln.
შესაბამისად, რა არის გასწორების ქულა?
ოპტიმალური გასწორება და გასწორების ქულა ოპტიმალური გასწორება არის გასწორება იძლევა უმაღლესს ქულა , და გასწორების ქულა ეს არის უმაღლესი ქულა . ანუ, გასწორების ქულა X და Y = ქულა X და Y ოპტიმალურის ქვეშ გასწორება . მაგალითად, გასწორების ქულა შემდეგი X და Y არის 36.
გარდა ზემოთ, როგორ მუშაობს თანმიმდევრობის გასწორება? ბიოინფორმატიკაში ა თანმიმდევრობის გასწორება არის მოწყობის საშუალება თანმიმდევრობები დნმ-ის, რნმ-ის ან ცილის მსგავსების რეგიონების იდენტიფიცირებისთვის, რომლებიც შეიძლება იყოს ფუნქციური, სტრუქტურული ან ევოლუციური ურთიერთობების შედეგი თანმიმდევრობები.
აქედან, რა არის ქულა ბიოინფორმატიკაში?
თანმიმდევრობის გასწორების კონტექსტში ა ქულა არის რიცხვითი მნიშვნელობა, რომელიც აღწერს გასწორების საერთო ხარისხს. უფრო მაღალი რიცხვები შეესაბამება უფრო მაღალ მსგავსებას. The ქულა მასშტაბი დამოკიდებულია გოლის გატანა გამოყენებული სისტემა (ჩანაცვლების მატრიცა, უფსკრული ჯარიმა).
რა არის ოპტიმალური გასწორება მიმდევრობის გასწორებაში?
The ოპტიმალური განლაგება ორი ცილისგან თანმიმდევრობები არის გასწორება რაც მაქსიმუმს მატებს წყვილთა ქულების ჯამს, აკლდება ნებისმიერი ჯარიმა შემოღებული ხარვეზებისთვის. დინამიური პროგრამირება საშუალებას იძლევა ოპტიმალური განლაგება ორიდან თანმიმდევრობები უნდა მოიძებნოს mnstep-ების რიგით, სადაც m და n არის სიგრძის თანმიმდევრობები.
გირჩევთ:
როგორ გამოითვლება MZ მნიშვნელობა?
ამოღებული ელექტრონების რაოდენობა არის მუხტის რიცხვი (დადებითი იონებისთვის). m/z წარმოადგენს მასას გაყოფილი მუხტის რიცხვზე და ჰორიზონტალური ღერძი მასის სპექტრში გამოხატულია m/z-ის ერთეულებში. ვინაიდან z თითქმის ყოველთვის არის 1 GCMS-ით, m/z მნიშვნელობა ხშირად ითვლება მასად
როგორ გამოითვლება დნმ-ის კონცენტრაცია სპექტროფოტომეტრის გამოყენებით?
დნმ-ის კონცენტრაცია შეფასებულია შთანთქმის გაზომვით 260 ნმ-ზე, A260 გაზომვის კორექტირებით სიმღვრივეზე (გაზომილი შთანთქმით 320 ნმ-ზე), გამრავლებით განზავების ფაქტორზე და იმ ურთიერთობის გამოყენებით, რომ A260 არის 1.0 = 50 მკგ/მლ სუფთა dsDNA
როგორ გამოითვლება ლიფტით გამოწვეული წევა?
ინდუცირებული წევის კოეფიციენტი უდრის ამწევის კოეფიციენტის კვადრატს (Cl) გაყოფილი რაოდენობაზე: pi (3.14159) გამრავლებული ასპექტის თანაფარდობაზე (Ar) გამრავლებული ეფექტურობის ფაქტორზე (e). ასპექტის თანაფარდობა არის სიგრძის კვადრატი გაყოფილი ფრთის ფართობზე
როგორ გამოითვლება გენეტიკური რუქის მანძილი?
ორ ადგილს შორის გადაკვეთის სიხშირე (% რეკომბინაცია) პირდაპირ კავშირშია ამ ორ ადგილს შორის არსებულ ფიზიკურ მანძილზე. პროცენტული რეკომბინაცია სატესტო ჯვარში უდრის რუკის მანძილს (1 რუკის ერთეული = 1% რეკომბინაცია)
როგორ გამოითვლება გადაადგილების მოცულობა აფთიაქში?
წამლის X-ის გადაადგილების მოცულობა არის 0.5მლ/40მგ. თუ საჭირო კონცენტრაცია არის 4მგ 1მლ-ში, მაშინ საჭიროა 20მლ 80მგ X პრეპარატი. საჭიროა 20მლ – 1მლ = 19მლ გამხსნელი